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大白菜属于十字花科（Cruciferae）芸薹属（Brassica）白菜（或云薹）种（Brassica rapa L.或Brassica campestris L.）的大白菜亚种（Brassica rapa ssp.pekinensis）。大白菜的近缘植物包括小白菜、芜菁、菜薹、乌塌菜、分蘖菜、薹菜和白菜型油菜等，通称为白菜类蔬菜。白菜类蔬菜是非常复杂的杂合群体，是天然异花授粉作物，种内各类型间的杂交毫无障碍，从而造成其品种繁多。其不同品种长期在不同生态环境下栽培，经过杂交选择，使现有品种无论在形态、生长发育习性、生态适应性上都有很复杂的变异。这就给白菜类作物种质资源的调查收集和系统整理工作带来了困难。因此，白菜类作物的分类和命名一直比较混乱。
瑞典植物学家林奈（Sp.Pl.2：666.1753）最早命名了与白菜植物有关的2个种，即芜菁Brassica rapa L.和野油菜（芸薹）Brassica campestris L.。Johann Metzger（1833）首次将这两个种合并为一个种，采用B.rapa作为种名，因此，B.rapa这个种名有优先权（St.Louis Code，Art.11.5），并且越来越流行。
在中国，芸薹用于描述野油菜，一种一年生的野生植物，起源于欧亚交界地区，可以在路边及野外见到。中国部分地区曾作为油料植物栽培，嫩茎叶可作蔬菜。中国的白菜类植物包括白菜类蔬菜和白菜型油菜等，因此，将Brassica rapa称作白菜种更容易理解和记忆。
芜菁是欧、亚大陆普遍栽培的蔬菜作物，欧洲斯堪的纳维亚半岛各国大量栽培饲用芜菁，美洲栽培的芜菁由欧洲引入。De Candolle（1886）报道芜菁在公元前2500～2000年前开始栽培，公元前1000年后传入亚洲。据记载，芜菁是白菜类作物中最古老的栽培种类型（Siemonsma和Piluek，1993）。普遍认为芜菁的起源中心在地中海沿岸及阿富汗、巴基斯坦、外高加索等地。
自日本学者盛永（Norinaga，T.，1929—1934）和禹长春（U.Nagah，1935）等人，通过对芸薹属植物不同的种间杂交及其杂种染色体数目研究，并总结前人试验结果，提出把芸薹属近缘植物分为基本种和复合种两大类，并把它们的种间亲缘关系用三角形表示（图4-1），大白菜即属于3个基本种中的白菜（或芸薹）（B.rapa L.，n＝10），染色体组AA。另外2个基本种是黑芥（B.nigra Roch.，n＝8），染色体组BB；甘蓝（B.oleracea L.，n＝9），染色体组CC。
图4-1 芸薹属6个种之间的关系
鉴于大白菜、小白菜、芜菁、菜薹、白菜型油菜等植物的亲缘关系很近，主要特征和特性相似，杂交率可达100%，而且杂种可以正常生长和繁殖。同时从细胞学的综合研究中也可看出染色体数全都为2n＝20，并属于同一染色体组。因此，这些植物应该属于同一种。1986年德国学者对芸薹属植物进行了系统研究，将白菜类植物分类为8个亚种。
表4-3 白菜种的亚种
大白菜在植物学分类中的地位经历了很多的演变，不同时期和不同国家的植物分类学家的命名颇不一致，分别命名为种、亚种或者变种。根据现代研究，大白菜应该列为白菜（云薹）种的一个亚种，拉丁名为Brassica rapa ssp.pekinensis（Lour.）Hanelt（1986）。
1.将大白菜分类为单独的种
最早给大白菜命名的是葡萄牙人Loureiro（1790），在Flora Cochinchinensis中将大白菜命名为一个独立的种Sinapis pekinensis。俄国植物学家庐甫列彻（Franz J.Ruprecht，1860）将大白菜定命名为Brassica pekinensis。美国植物学家贝利（L.H.Bailey，1994）对种子来自中国的大白菜进行了系统而仔细的研究，甚至用白菜的中文发音将大白菜定命名为Brassica pe-tsai。
2.将大白菜分类为亚种
俄国植物学家季托夫（M.Titov，1891）则把大白菜列为B.chinenis的两个亚种之一，大白菜定为ssp.laminata Titov。瑞典的G.Olsson（1954）在对白菜类植物进行杂交研究的基础上，将大白菜定命名为Brassica campestris ssp.pekinensis（Lour.）Olsson。1986年德国学者对芸薹属植物进行了系统研究，将大白菜分类为一个亚种，定名为Brassica rapa ssp.pekinensis（Lour.）Hanelt，现已被越来越多地接受和使用。
3.将大白菜分类为变种
德国的O.E.Schulz于1919年将大白菜定名为Brassica napus var.chinensis（L.）Schulz。中国学者曾勉和李曙轩（1942）将大白菜划分为3个类型的变种，直筒形cylindrical Tsen et Lee，头球型cephalate Tsen et Lee，花心型laxa Tsen et Lee。孙逢吉（1946）则将大白菜分类为一个变种Brassica chinensis var.pekinensis（Lour.）Sun。日本植物学家牧野富太郎（Tomitaro Makino）认为大白菜是芸薹的一个变种，命名为B.campestris L.ssp.chinensis Makino var.amplexicaulis Makino。
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